Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms