Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TXNRD1Q16881 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD1Q16881 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms