Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6V1FQ16864 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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