Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FOXD1Q16676 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD1Q16676 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
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