Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM1Q16610 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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