Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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