Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYPL1Q16563 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYPL1Q16563 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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