Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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