Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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ZNF56Q15929 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF56Q15929 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF56Q15929 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF56Q15929 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms