Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms