Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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NPTX1Q15818 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPTX1Q15818 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
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