Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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