Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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