Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms