Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT31Q15323 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms