Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms