Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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