Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHPRHQ149N8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
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