Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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