Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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