Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
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