Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HNF4GQ14541 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms