Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL9A3Q14050 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A3Q14050 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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