Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRF1Q13972 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
RASGRF1Q13972 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRF1Q13972 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms