Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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