Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7AQ13946 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms