Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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