Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR4Q13639 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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