Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NAE1Q13564 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NAE1Q13564 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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NAE1Q13564 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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NAE1Q13564 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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NAE1Q13564 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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NAE1Q13564 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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