Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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