Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BFSP2Q13515 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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