Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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