Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXE3Q13461 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXE3Q13461 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXE3Q13461 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXE3Q13461 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXE3Q13461 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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