Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms