Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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