Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDRQ13258 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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