Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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