Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ARMC6-219ENST00000545091 1079 ntTSL 517.56■□□□□ 0.47e-8■■■■□ 26.7
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TARDBPQ13148 ARMC6-215ENST00000540792 951 ntTSL 214.36□□□□□ -0.117e-8■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 ARMC6-216ENST00000541725 560 ntTSL 512.72□□□□□ -0.377e-8■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 212.69□□□□□ -0.387e-8■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 311.18□□□□□ -0.627e-8■■■■□ 26.7
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TARDBPQ13148 ARHGAP11B-202ENST00000562954 652 ntTSL 37.16□□□□□ -1.263e-8■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.55e-7■■■■□ 26.7
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TARDBPQ13148 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.125e-7■■■■□ 26.7
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TARDBPQ13148 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.384e-9■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-9■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-9■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-9■■■■□ 26.7
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TARDBPQ13148 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.438e-7■■■■□ 26.7
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TARDBPQ13148 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.269e-7■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 54.32□□□□□ -1.729e-7■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-12■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 512.08□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 310.32□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 26.6
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TARDBPQ13148 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 PAFAH1B1-203ENST00000570400 661 ntTSL 313.9□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 26.6
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TARDBPQ13148 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.42e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 NAP1L4-215ENST00000528363 685 ntTSL 26.56□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 LMBR1-206ENST00000430825 1208 ntTSL 517.63■□□□□ 0.417e-8■■■■□ 26.6
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TARDBPQ13148 DIP2B-204ENST00000549620 2676 ntTSL 1 (best)18.08■□□□□ 0.495e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.245e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 26.6
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TARDBPQ13148 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-8■■■■□ 26.6
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TARDBPQ13148 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 ADAR-207ENST00000526905 490 ntTSL 37.62□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 IMMT-209ENST00000474969 1431 ntTSL 513.05□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 IMMT-203ENST00000409258 1408 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 IMMT-210ENST00000486633 631 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 26.6
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TARDBPQ13148 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.319e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.269e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-210ENST00000494703 796 ntTSL 218.18■□□□□ 0.54e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.374e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-211ENST00000495510 2001 ntTSL 213.76□□□□□ -0.214e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.54e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-206ENST00000476377 362 ntTSL 26.6□□□□□ -1.354e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.654e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.654e-8■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-9■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 TMEM56-RWDD3-201ENST00000604203 680 ntTSL 36.22□□□□□ -1.412e-9■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 LINC02405-202ENST00000540244 689 ntTSL 39.13□□□□□ -0.959e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 LINC02405-203ENST00000546062 563 ntTSL 38.77□□□□□ -1.019e-7■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 216.49■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 47.13□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 43.09□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.44□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 26.6
TARDBPQ13148 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.864e-7■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.588e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MICAL3-205ENST00000424046 542 ntTSL 417.69■□□□□ 0.428e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.168e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.28e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.268e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 CNOT4-211ENST00000498534 481 ntTSL 212.36□□□□□ -0.438e-8■■■■□ 26.5
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