Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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