Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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NR1H3Q13133 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1H3Q13133 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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