Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP4Q13115 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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