Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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