Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX10Q12887 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COX10Q12887 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COX10Q12887 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COX10Q12887 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COX10Q12887 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COX10Q12887 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COX10Q12887 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms