Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNTN1Q12860 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNTN1Q12860 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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