Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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