Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CPSF1Q10570 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms