Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms