Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms