Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACSM2AQ08AH3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM2AQ08AH3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms