Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL1Q08397 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms